single nucleotide polymorphisms of dna methyltransferase 1 gene and gastric cancer in iranian patients: a case control study

[ ' s i n g l e n u c l e o t i d e p o l y m o r p h i s m s ( s n p s ) ' , ' d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e 1 ( d n m t 1 ) ' , ' g a s t r i c c a n c e r ( g c ) r e f e r e n c e s 1 . l a i r d p w ' , ' j a e n i s c h r . d n a m e t h y l a t i o n a n d c a n c e r . h u m m o l g e n e t . 1 9 9 4 ' , ' 3 s p e c n o ' , 1 4 8 7 , ' 9 5 . 2 . k o n d o y ' , ' k a n a i y ' , ' s a k a m o t o m ' , ' m i z o k a m i m ' , ' u e d a r ' , ' h i r o h a s h i s . g e n e t i c i n s t a b i l i t y a n d a b e r r a n t d n a m e t h y l a t i o n i n c h r o n i c h e p a t i t i s a n d c i r r h o s i s ' , ' a c o m p r e h e n s i v e s t u d y o f l o s s o f h e t e r o z y g o s i t y a n d m i c r o s a t e l l i t e i n s t a b i l i t y a t 3 9 l o c i a n d d n a h y p e r m e t h y l a t i o n o n 8 c p g i s l a n d s i n m i c r o d i s s e c t e d s p e c i m e n s f r o m p a t i e n t s w i t h h e p a t o c e l l u l a r c a r c i n o m a . h e p a t o l o g y . 2 0 0 0 n o v ' , ' 3 2 ( 5 ) ' , 9 7 0 , ' 9 . 3 . o k a n o m ' , ' x i e s ' , ' l i e . c l o n i n g a n d c h a r a c t e r i z a t i o n o f a f a m i l y o f n o v e l m a m m a l i a n d n a ( c y t o s i n e ' , ' 5 ) m e t h y l t r a n s f e r a s e s . n a t g e n e t . 1 9 9 8 ' , ' 1 9 ( 3 ) ' , 2 1 9 , ' 2 0 . 1 2 3 4 5 6 7 8 9 4 . j o n e s p a ' , ' b a y l i n s b . t h e f u n d a m e n t a l r o l e o f e p i g e n e t i c e v e n t s i n c a n c e r . n a t r e v g e n e t . 2 0 0 2 ' , ' 3 ( 6 ) ' , 4 1 5 , ' 2 8 . 5 . s k l i r i s g p ' , ' m u n o t k ' , ' b e l l s m ' , ' c a r d e r p j ' , ' l a n e s ' , ' h o r g a n k ' , ' e t a l . r e d u c e d e x p r e s s i o n o f o e s t r o g e n r e c e p t o r b e t a i n i n v a s i v e b r e a s t c a n c e r a n d i t s r e ' , ' e x p r e s s i o n u s i n g d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e i n h i b i t o r s i n a c e l l l i n e m o d e l . j p a t h o l . 2 0 0 3 ' , ' 2 0 1 ( 2 ) ' , 2 1 3 , ' 2 0 . 6 . d i n c e r y ' , ' a k c a y t ' , ' c e l e b i n ' , ' u s l u i ' , ' o z m e n o ' , ' h a t e m i h . g l u t a t h i o n e s ' , ' t r a n s f e r a s e a n d o 6 ' , ' m e t h y l g u a n i n e d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e a c t i v i t i e s i n p a t i e n t s w i t h t h y r o i d p a p i l l a r y c a r c i n o m a . c a n c e r i n v e s t . 2 0 0 2 ' , ' 2 0 ( 7 ' , ' 8 ) ' , 9 6 5 , ' 7 1 . 7 . n i e d e r r e i t h e r k ' , ' h a r b e r s m ' , ' c h a m b o n p ' , ' d o l l e p . e x p r e s s i o n o f t ' , ' g m i s m a t c h ' , ' s p e c i f i c t h y m i d i n e ' , ' d n a g l y c o s y l a s e a n d d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e g e n e s d u r i n g d e v e l o p m e n t a n d t u m o r i g e n e s i s 5 . o n c o g e n e . 1 9 9 8 ' , ' 1 7 ( 1 2 ) ' , 1 5 7 7 , ' 8 5 . 8 . w a n g y m ' , ' w a n g r ' , ' w e n d g ' , ' l i y ' , ' g u o w ' , ' w a n g n ' , ' e t a l . s i n g l e n u c l e o t i d e p o l y m o r p h i s m i n d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e 3 b p r o m o t e r a n d i t s a s s o c i a t i o n w i t h g a s t r i c c a r d i a c a d e n o c a r c i n o m a i n n o r t h c h i n a . w o r l d j g a s t r o e n t e r o l . 2 0 0 5 ' , ' 1 1 ( 2 3 ) ' , 3 6 2 3 , ' 7 . 9 . l i u k ' , ' w a n g y f ' , ' c a n t e m i r c ' , ' m u l l e r m t . e n d o g e n o u s a s s a y s o f d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e s ' , ' e v i d e n c e f o r d i f f e r e n t i a l a c t i v i t i e s o f d n m t 1 ' , ' d n m t 2 ' , ' a n d d n m t 3 i n m a m m a l i a n c e l l s i n v i v o . m o l c e l l b i o l . 2 0 0 3 ' , ' 2 3 ( 8 ) ' , 2 7 0 9 , ' 1 9 . 1 0 . o k a n o m ' , ' b e l l d w ' , ' h a b e r d a ' , ' l i e . d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e s d n m t 3 a a n d d n m t 3 b a r e e s s e n t i a l f o r d e n o v o m e t h y l a t i o n a n d m a m m a l i a n d e v e l o p m e n t . c e l l . 1 9 9 9 ' , ' 9 9 ( 3 ) ' , 2 4 7 , ' 5 7 . 1 1 . j a i r k w ' , ' b a c h m a n k e ' , ' s u z u k i h ' , ' t i n g a h ' , ' r h e e i ' , ' y e n r w ' , ' e t a l . d e n o v o c p g i s l a n d m e t h y l a t i o n i n h u m a n c a n c e r c e l l s . c a n c e r r e s . 2 0 0 6 ' , ' 6 6 ( 2 ) ' , 6 8 2 , ' 9 2 . 1 2 . t u r e k ' , ' p l e w a j ' , ' j a g o d z i n s k i p p . t h e r o l e o f m a m m a l i a n d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e s i n t h e r e g u l a t i o n o f g e n e e x p r e s s i o n . c e l l m o l b i o l l e t t . 2 0 0 5 ' , ' 1 0 ( 4 ) ' , 6 3 1 , ' 4 7 . 1 3 . k a n a i y ' , ' u s h i j i m a s ' , ' k o n d o y ' , ' n a k a n i s h i y ' , ' h i r o h a s h i s . d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e e x p r e s s i o n a n d d n a m e t h y l a t i o n o f c p g i s l a n d s a n d p e r i ' , ' c e n t r o m e r i c s a t e l l i t e r e g i o n s i n h u m a n c o l o r e c t a l a n d s t o m a c h c a n c e r s 1 6 7 . i n t j c a n c e r . 2 0 0 1 ' , ' 9 1 ( 2 ) ' , 2 0 5 , ' 1 2 . 1 4 . s a i t o y ' , ' k a n a i y ' , ' s a k a m o t o m ' , ' s a i t o h ' , ' i s h i i h ' , ' h i r o h a s h i s . e x p r e s s i o n o f m r n a f o r d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e s a n d m e t h y l ' , ' c p g ' , ' b i n d i n g p r o t e i n s a n d d n a m e t h y l a t i o n s t a t u s o n c p g i s l a n d s a n d p e r i c e n t r o m e r i c s a t e l l i t e r e g i o n s d u r i n g h u m a n h e p a t o c a r c i n o g e n e s i s 3 7 4 . h e p a t o l o g y . 2 0 0 1 ' , ' 3 3 ( 3 ) ' , 5 6 1 , ' 8 . 1 5 . a r a u j o f d ' , ' k n o x j d ' , ' r a m c h a n d a n i s ' , ' p e l l e t i e r r ' , ' b i g e y p ' , ' p r i c e g ' , ' e t a l . i d e n t i f i c a t i o n o f i n i t i a t i o n s i t e s f o r d n a r e p l i c a t i o n i n t h e h u m a n d n m t 1 ( d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e ) l o c u s . j b i o l c h e m 1 9 9 9 ' , ' 2 7 4 ( 1 4 ) ' , 9 3 3 5 , ' 4 1 . 1 6 . d e t i c h n ' , ' r a m c h a n d a n i s ' , ' s z y f m . a c o n s e r v e d 3 & ' , ' # 0 3 9 ' , ' u n t r a n s l a t e d e l e m e n t m e d i a t e s g r o w t h r e g u l a t i o n o f d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e 1 a n d i n h i b i t s i t s t r a n s f o r m i n g a c t i v i t y . j b i o l c h e m . 2 0 0 1 ' , ' 2 7 6 ( 2 7 ) ' , 2 4 8 8 1 , ' 9 0 . 1 7 . s a u e r s ' , ' l e c h n e r d ' , ' b e r l i n k ' , ' l e h r a c h h ' , ' e s c a r y j l ' , ' f o x n ' , ' e t a l . a n o v e l p r o c e d u r e f o r e f f i c i e n t g e n o t y p i n g o f s i n g l e n u c l e o t i d e p o l y m o r p h i s m s . n u c l e i c a c i d s r e s . 2 0 0 0 ' , ' 2 8 ( 5 ) ' , ' e 1 3 . 1 8 . h e m m i n k i k ' , ' f o r s t i a ' , ' l o r e n z o b j . s i n g l e n u c l e o t i d e p o l y m o r p h i s m s ( s n p s ) a r e i n h e r i t e d f r o m p a r e n t s a n d t h e y m e a s u r e h e r i t a b l e e v e n t s . j c a r c i n o g . 2 0 0 5 ' , ' 4 ( 1 ) ' , ' 2 . 1 9 . m i a o x ' , ' y u c ' , ' t a n w ' , ' x i o n g p ' , ' l i a n g g ' , ' l u w ' , ' e t a l . a f u n c t i o n a l p o l y m o r p h i s m i n t h e m a t r i x m e t a l l o p r o t e i n a s e ' , ' 2 g e n e p r o m o t e r ( ' , ' 1 3 0 6 c / t ) i s a s s o c i a t e d w i t h r i s k o f d e v e l o p m e n t b u t n o t m e t a s t a s i s o f g a s t r i c c a r d i a a d e n o c a r c i n o m a . c a n c e r r e s . 2 0 0 3 ' , ' 6 3 ( 1 4 ) ' , 3 9 8 7 , ' 9 0 . 2 0 . s t o l z e n b e r g ' , ' s o l o m o n r z ' , ' q i a o y l ' , ' a b n e t c c ' , ' r a t n a s i n g h e d l ' , ' d a w s e y s m ' , ' d o n g z w ' , ' e t a l . e s o p h a g e a l a n d g a s t r i c c a r d i a c a n c e r r i s k a n d f o l a t e ' , ' a n d v i t a m i n b ( 1 2 ) ' , ' r e l a t e d p o l y m o r p h i s m s i n l i n x i a n ' , ' c h i n a . c a n c e r e p i d e m i o l b i o m a r k e r s p r e v . 2 0 0 3 ' , ' 1 2 ( 1 1 p t 1 ) ' , 1 2 2 2 , ' 6 . 2 1 . z h a n g j ' , ' l i y ' , ' w a n g r ' , ' w e n d ' , ' s a r b i a m ' , ' k u a n g g ' , ' e t a l . a s s o c i a t i o n o f c y c l i n d 1 ( g 8 7 0 a ) p o l y m o r p h i s m w i t h s u s c e p t i b i l i t y t o e s o p h a g e a l a n d g a s t r i c c a r d i a c c a r c i n o m a i n a n o r t h e r n c h i n e s e p o p u l a t i o n . i n t j c a n c e r . 2 0 0 3 ' , ' 1 0 5 ( 2 ) ' , 2 8 1 , ' 4 . 2 2 . j o h n s w ' , ' w e i t z n e r g ' , ' r o z e n r ' , ' s c r i v e r c r . a r a p i d p r o c e d u r e f o r e x t r a c t i n g g e n o m i c d n a f r o m l e u k o c y t e s 4 . n u c l e i c a c i d s r e s . 1 9 9 1 ' , ' 1 9 ( 2 ) ' , ' 4 0 8 . 2 3 . e g u c h i k ' , ' k a n a i y ' , ' k o b a y a s h i k ' , ' h i r o h a s h i s . d n a h y p e r m e t h y l a t i o n a t t h e d 1 7 s 5 l o c u s i n n o n ' , ' s m a l l c e l l l u n g c a n c e r s ' , ' i t s a s s o c i a t i o n w i t h s m o k i n g h i s t o r y . c a n c e r r e s . 1 9 9 7 ' , ' 5 7 ( 2 1 ) ' , 4 9 1 3 , ' 5 . 2 4 . k a n a i y ' , ' u s h i j i m a s ' , ' h u i a m ' , ' o c h i a i a ' , ' t s u d a h ' , ' s a k a m o t o m ' , ' e t a l . t h e e ' , ' c a d h e r i n g e n e i s s i l e n c e d b y c p g m e t h y l a t i o n i n h u m a n h e p a t o c e l l u l a r c a r c i n o m a s 2 7 7 . i n t j c a n c e r . 1 9 9 7 ' , ' 7 1 ( 3 ) ' , 3 5 5 , ' 9 . 2 5 . k a n a i y ' , ' u s h i j i m a s ' , ' o c h i a i a ' , ' e g u c h i k ' , ' h u i a ' , ' h i r o h a s h i s . d n a h y p e r m e t h y l a t i o n a t t h e d 1 7 s 5 l o c u s i s a s s o c i a t e d w i t h g a s t r i c c a r c i n o g e n e s i s 2 6 2 . c a n c e r l e t t 1 9 9 8 ' , ' 1 2 2 ( 1 ' , ' 2 ) ' , 1 3 5 , ' 4 1 . 2 6 . k a n a i y ' , ' u s h i j i m a s ' , ' t s u d a h ' , ' s a k a m o t o m ' , ' h i r o h a s h i s . a b e r r a n t d n a m e t h y l a t i o n p r e c e d e s l o s s o f h e t e r o z y g o s i t y o n c h r o m o s o m e 1 6 i n c h r o n i c h e p a t i t i s a n d l i v e r c i r r h o s i s 2 0 0 . c a n c e r l e t t . 2 0 0 0 ' , ' 1 4 8 ( 1 ) ' , 7 3 , ' 8 0 . 2 7 . k a n a i y ' , ' u s h i j i m a s ' , ' k o n d o y ' , ' n a k a n i s h i y ' , ' h i r o h a s h i s . d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e e x p r e s s i o n a n d d n a m e t h y l a t i o n o f c p g i s l a n d s a n d p e r i ' , ' c e n t r o m e r i c s a t e l l i t e r e g i o n s i n h u m a n c o l o r e c t a l a n d s t o m a c h c a n c e r s 1 6 7 . i n t j c a n c e . r 2 0 0 1 ' , ' 9 1 ( 2 ) ' , 2 0 5 , ' 1 2 . 2 8 . e t o h t ' , ' k a n a i y ' , ' u s h i j i m a s ' , ' n a k a g a w a t ' , ' n a k a n i s h i y ' , ' s a s a k o m ' , ' e t a l . i n c r e a s e d d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e 1 ( d n m t 1 ) p r o t e i n e x p r e s s i o n c o r r e l a t e s s i g n i f i c a n t l y w i t h p o o r e r t u m o r d i f f e r e n t i a t i o n a n d f r e q u e n t d n a h y p e r m e t h y l a t i o n o f m u l t i p l e c p g i s l a n d s i n g a s t r i c c a n c e r s 1 0 . a m j p a t h o l 2 0 0 4 ' , ' 1 6 4 ( 2 ) ' , 6 8 9 , ' 9 9 . 2 9 . s a i t o y ' , ' k a n a i y ' , ' s a k a m o t o m ' , ' s a i t o h ' , ' i s h i i h ' , ' h i r o h a s h i s . e x p r e s s i o n o f m r n a f o r d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e s a n d m e t h y l ' , ' c p g ' , ' b i n d i n g p r o t e i n s a n d d n a m e t h y l a t i o n s t a t u s o n c p g i s l a n d s a n d p e r i c e n t r o m e r i c s a t e l l i t e r e g i o n s d u r i n g h u m a n h e p a t o c a r c i n o g e n e s i s 3 7 4 . h e p a t o l o g y 2 0 0 1 ' , ' 3 3 ( 3 ) ' , 5 6 1 , ' 8 . 3 0 . s z y f m ' , ' b o z o v i c v ' , ' t a n i g a w a g . g r o w t h r e g u l a t i o n o f m o u s e d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e g e n e e x p r e s s i o n . j b i o l c h e m 1 9 9 1 ' , ' 2 6 6 ( 1 6 ) ' , 2 0 0 2 7 , ' 3 0 . 3 1 . r o b e r t s o n k d ' , ' k e y o m a r s i k ' , ' g o n z a l e s f a ' , ' v e l i c e s c u m ' , ' j o n e s p a . d i f f e r e n t i a l m r n a e x p r e s s i o n o f t h e h u m a n d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e s ( d n m t s ) 1 ' , ' 3 a a n d 3 b d u r i n g t h e k h a t a m i e t a l . i r a n i a n j o u r n a l o f c a n c e r p r e v e n t i o n 1 1 8 g ( 0 ) / g ( 1 ) t o s p h a s e t r a n s i t i o n i n n o r m a l a n d t u m o r c e l l s . n u c l e i c a c i d s r e s 2 0 0 0 ' , ' 2 8 ( 1 0 ) ' , 2 1 0 8 , ' 1 3 . 3 2 . d e t i c h n ' , ' r a m c h a n d a n i s ' , ' s z y f m . a c o n s e r v e d 3 & ' , ' # 0 3 9 ' , ' u n t r a n s l a t e d e l e m e n t m e d i a t e s g r o w t h r e g u l a t i o n o f d n a m e t h y l t r a n s f e r a s e 1 a n d i n h i b i t s i t s t r a n s f o r m i n g a c t i v i t y . j b i o l c h e m 2 0 0 1 ' , ' 2 7 6 ( 2 7 ) ' , 2 4 8 8 1 , ' 9 0 . 3 3 . r h e e i ' , ' j a i r k w ' , ' y e n r w ' , ' l e n g a u e r c ' , ' h e r m a n j g ' , ' k i n z l e r k w ' , ' e t a l . c p g m e t h y l a t i o n i s m a i n t a i n e d i n h u m a n c a n c e r c e l l s l a c k i n g d n m t 1 2 2 . n a t u r e 2 0 0 0 ' , ' 4 0 4 ( 6 7 8 1 ) ' , 2 0 0 3 , ' 7 . ' ]